Le Maccabi Paris Métropole trouve ses origines dans l’histoire de deux clubs issus de communautés fortement implantées dans l’Est et le Sud-Est parisien. La première racine remonte à 1926, avec la création à Alfortville de l’Union de la Jeunesse Arménienne (UJA), fondée au sein de la communauté arménienne locale. L’UJA devient progressivement un acteur important de la vie sportive d’Alfortville et connaît plusieurs décennies d’existence au niveau départemental et régional. De son côté, le SC Maccabi Paris, créé en 1947, développe une importante activité sportive au sein de la communauté juive parisienne. Ces deux histoires, distinctes à l’origine, vont finalement se rejoindre plusieurs décennies plus tard.
À partir de la fin des années 1990, l’UJA Alfortville connaît une spectaculaire progression sportive. Après une première accession en Promotion d’Honneur en 1998, le club enchaîne les montées et atteint successivement la DHR en 1999, la DSR en 2000 puis la Division d’Honneur en 2006. En 2007, l’UJA décroche le titre de champion de Division d’Honneur d’Île-de-France et accède pour la première fois au niveau national, en CFA 2 (actuel National 3). Cette accession constitue un tournant majeur dans l’histoire du club.
L’ascension se poursuit rapidement. Dès la saison suivante, l’UJA Alfortville remporte son groupe de CFA 2 et obtient en 2008 une nouvelle promotion en CFA, deuxième échelon national de l’époque. Après deux saisons à ce niveau, le club accède au Championnat National en 2010, notamment grâce à son statut de meilleur deuxième de CFA après les difficultés administratives et financières rencontrées par plusieurs clubs. L’UJA découvre ainsi le troisième niveau du football français lors de la saison 2010-2011. Cette aventure nationale est cependant de courte durée puisque le club termine la saison à la 20e place et retrouve le CFA en 2011.
C’est dans ce contexte qu’intervient une étape déterminante de l’histoire du club. En juin 2012, l’UJA Alfortville fusionne avec la section football du SC Maccabi Paris, alors engagée en Division Supérieure Régionale. Cette union donne naissance à l’UJA Maccabi Paris Métropole, avec l’ambition de réunir les forces sportives, humaines et associatives des deux structures. Le nouveau club conserve notamment l’ancrage val-de-marnais de l’UJA et l’identité parisienne du Maccabi, tandis que l’appellation « Paris Métropole » symbolise cette volonté de construire un club à l’échelle de l’agglomération parisienne.
Après la fusion, le club poursuit son activité au niveau national avant de connaître une période plus difficile. En 2017, le Maccabi Paris Métropole quitte le niveau national et entame une descente progressive dans les divisions régionales. Malgré ces difficultés sportives, le club conserve un ancrage historique fort entre Paris et le Val-de-Marne, héritage de près d’un siècle d’histoire depuis la création de l’UJA en 1926 et de plus de sept décennies pour le Maccabi Paris. Aujourd’hui, le Maccabi Paris Métropole demeure ainsi l’héritier de deux traditions sportives et communautaires distinctes, réunies autour d'un même projet footballistique.