Fondés le 12 avril 1910 à Anglet, les Genêts d’Anglet sont l’un des clubs historiques du football du Pays basque et des Pyrénées-Atlantiques. Issu à l’origine d’un patronage catholique, le club développe dès ses premières années une activité footballistique aux côtés d’autres sections sportives et culturelles. Les Genêts adoptent leurs célèbres couleurs jaune et vert, inspirées des genêts qui caractérisaient alors les paysages et les pignadas d’Anglet. En 1912, le club rejoint notamment l’Union Pyrénéenne, marquant ses premiers pas dans l’organisation du football régional. Au fil des décennies, les Genêts s’implantent durablement dans la vie sportive angloye, notamment sur le site de Choisy à partir de 1955.
Après plusieurs décennies passées dans les championnats régionaux, les Genêts d’Anglet connaissent une progression spectaculaire au début des années 2000. Sous l’impulsion notamment de Jean-Louis Cazes, le club retrouve la Division d’Honneur en 2001 avant de franchir un nouveau cap. En 2003, Anglet remporte la Coupe d’Aquitaine et atteint les 32es de finale de la Coupe de France, où les Angloys s’inclinent face à l’En Avant de Guingamp, alors pensionnaire de Ligue 1, sur un but de Didier Drogba. Cette même période marque l’accession des Genêts au championnat de France : deuxièmes de leur groupe de Division d’Honneur en 2003-2004, ils rejoignent le CFA 2, correspondant au cinquième niveau national.
La progression se poursuit immédiatement puisque les Genêts d’Anglet accèdent au CFA dès la saison 2004-2005. Le club confirme son installation au niveau national et remporte à nouveau la Coupe d’Aquitaine en 2006. En 2007, la section football devient une association indépendante, dans le cadre de la réorganisation exigée par les instances fédérales et la DNCG. Les années suivantes sont marquées par plusieurs saisons disputées au quatrième niveau national, avec notamment un maintien obtenu lors de la dernière journée de la saison 2009-2010, année du centenaire du club. Anglet connaît ensuite une période plus difficile et est relégué en CFA 2 à l’issue de la saison 2011-2012.
Après plusieurs saisons en CFA 2 puis en National 3, les Genêts retrouvent progressivement les premiers rôles dans leur groupe. Le club remporte notamment la Coupe de Nouvelle-Aquitaine en 2018 et s’installe durablement parmi les équipes ambitieuses du championnat de National 3. Cette dynamique atteint son point culminant en 2023-2024 : Anglet termine premier de son groupe de National 3 après une victoire lors de la dernière journée contre la réserve des Girondins de Bordeaux et retrouve ainsi le National 2, quinze ans après l’avoir quitté. Les Genêts disputent alors de nouveau le quatrième niveau du football français lors de la saison 2024-2025.