L’histoire du Vierzon Football Club s’inscrit dans celle de plusieurs clubs historiques de la ville de Vierzon, dans le Cher. L’une de ses principales racines remonte à 1937 avec la création du Club Athlétique de la Jeunesse Ouvrière (CAJO) par l’abbé Chavet. Le CAJO possède alors plusieurs sections sportives, dont le football, le tennis et le basket-ball. Une autre branche importante de l’histoire du club actuel est constituée par l’Églantine vierzonnaise, issue de l’Églantine rouge de Vierzon-Villages fondée le 9 novembre 1935. Cette dernière devient l’Églantine vierzonnaise en 1938 et développe progressivement une importante activité footballistique dans la ville.
En 1991, la section football du CAJO fusionne avec l’Étoile Portugaise de Vierzon pour donner naissance au FC Vierzon. Le nouveau club progresse rapidement sous la direction de Mohamed Farhan, qui prend l’équipe en Promotion d’Honneur en 1998 et obtient une première accession en Division d’Honneur en 1999. En 2001, le FC Vierzon fusionne avec le Stade Vierzonnais, autre club historique de la ville qui avait notamment évolué pendant onze saisons en Division d’Honneur du Centre. Cette nouvelle union donne naissance au Vierzon Foot 18, qui devient rapidement l’une des formations majeures du football régional.
Le Vierzon Foot 18 connaît alors plusieurs périodes marquantes. En 2005, après avoir terminé vice-champion de Division d’Honneur du Centre, le club accède pour la première fois au Championnat de France Amateur 2 (CFA 2), alors cinquième niveau national. Pour sa première saison à ce niveau, il termine troisième de son groupe en 2005-2006. Après une relégation en 2007, le club retrouve le CFA 2 en 2010 grâce à son titre de champion du Centre. Il dispute ensuite deux nouvelles saisons au niveau national, en 2010-2011 et 2011-2012. Durant cette période, le Vierzon Foot 18 enrichit également son palmarès départemental avec plusieurs victoires en Coupe du Cher.
Une nouvelle étape décisive intervient en 2015 avec la fusion du Vierzon Foot 18 et de l’Églantine vierzonnaise. La nouvelle association, officiellement constituée au 1er juillet 2015, prend le nom de Vierzon Football Club. Cette fusion réunit ainsi deux importantes traditions du football local et donne naissance au club qui évolue encore aujourd’hui sous les couleurs du Vierzon FC. Le nouveau club s'illustre rapidement : vice-champion de Division d’Honneur Centre-Val de Loire en 2016, il remporte la Coupe Centre-Val de Loire en 2018, premier succès de la ville dans cette compétition.
Le Vierzon FC franchit un nouveau cap au début des années 2020. En 2022, l’équipe termine championne du groupe Centre-Val de Loire de National 3 et accède au National 2, retrouvant ainsi le quatrième niveau du football français. La saison 2022-2023 restera également historique avec un parcours exceptionnel en Coupe de France, le club atteignant pour la première fois les huitièmes de finale de la compétition. Cette période constitue l’un des sommets de l’histoire du football vierzonnais et prolonge la trajectoire d’un club construit au fil des décennies par plusieurs générations et plusieurs fusions.
