Fondé en 1969, le FC Saint-Jean-le-Blanc s’est progressivement imposé comme un club important du football dans le Loiret et dans l’agglomération orléanaise. Pendant plusieurs décennies, le club évolue principalement dans les championnats régionaux, tout en développant ses structures et sa formation. Cette progression permet au FC Saint-Jean-le-Blanc de franchir un premier cap majeur au début des années 2010, avec l’ambition de s’installer durablement parmi les clubs de référence de la région Centre-Val de Loire.
L’année 2011 constitue une date historique pour le FC Saint-Jean-le-Blanc. Après avoir remporté le championnat de Division d’Honneur Centre, l’équipe première accède pour la première fois de son histoire à un championnat national. Le club découvre alors le CFA 2, correspondant à l’époque au cinquième niveau du football français. Cette première expérience nationale est toutefois de courte durée : Saint-Jean-le-Blanc termine la saison 2011-2012 à la 16e place de son groupe et retrouve ensuite le championnat régional.
Après plusieurs saisons entre les différents échelons régionaux, le FC Saint-Jean-le-Blanc retrouve le niveau national en 2018, en accédant au National 3. Le club y évolue notamment lors des saisons 2018-2019, 2020-2021, 2021-2022 et 2022-2023. Cette dernière période constitue l'une des plus longues présences du club à ce niveau. En 2021-2022, le FC Saint-Jean-le-Blanc se maintient en National 3 avant de terminer la saison suivante à la 11e place de son groupe. Il est finalement relégué en Régional 1 à l’issue de l’exercice 2022-2023.
Le club connaît ensuite une nouvelle étape de reconstruction avant de retrouver le National 2 en 2026. Auteur d’une excellente saison 2025-2026 en Régional 1, le FC Saint-Jean-le-Blanc valide sa remontée au niveau national après une victoire 4-1 contre Saint-Cyr-sur-Loire, le 10 mai 2026, au terme d’une série de cinq succès consécutifs. Cette nouvelle accession illustre la capacité du club à rebondir et confirme ses ambitions sportives. Installé au stade Lionel-Charbonnier, le FC Saint-Jean-le-Blanc s’appuie également sur une importante politique de formation et sur un ensemble d’équipes masculines et féminines pour poursuivre son développement.