L’histoire du Saint-Nazaire Atlantique Football s’inscrit dans une tradition footballistique plus que centenaire à Saint-Nazaire. Elle remonte à 1908, avec la création du Sporting Club Nazairien, qui constitue l’un des principaux clubs ancêtres du football nazairien. Au fil des décennies, la section football se développe et gagne progressivement son indépendance, tandis que le club connaît plusieurs évolutions institutionnelles et changements de nom. Cette histoire ancienne constitue aujourd’hui le socle sur lequel s’est construit le Saint-Nazaire Atlantique Football, malgré les différentes fusions et transformations intervenues au cours du XXe et du début du XXIe siècle.
Le football nazairien connaît une première période faste au milieu des années 1950. Le club atteint le Championnat de France Amateur (CFA) en 1955, alors plus haut niveau du football amateur français. Cette présence au niveau national marque l’une des premières grandes réussites du football à Saint-Nazaire et permet au club de se mesurer à plusieurs des meilleures formations amateurs françaises. En 1965, une nouvelle étape est franchie avec la création de l’Atlantic Club Nazairien, nouvelle appellation qui accompagne la poursuite de l’activité du football local au sein des compétitions régionales et nationales.
L’identité du club évolue encore au cours des décennies suivantes. En 1991, l’Atlantic Club Nazairien devient le Saint-Nazaire Presqu’île Football Club, avant de prendre le nom de Saint-Nazaire Football Club en 2002. En 2007, le club adopte ensuite l’appellation Stade nazairien. Ces différentes dénominations reflètent les évolutions successives du football local, tout en maintenant une continuité sportive autour de la ville de Saint-Nazaire. Le Stade nazairien constitue ainsi l’un des deux principaux acteurs de la fusion qui donnera naissance à l’actuel SNAF.
En 2014, une nouvelle page s’ouvre avec la création du Saint-Nazaire Atlantique Football (SNAF). Le club naît de la fusion du Stade nazairien et du Saint-Nazaire Olympique Sporting (OS), avec l’objectif de réunir les forces du football nazairien au sein d’une structure commune. Le SNAF revendique ainsi l’héritage de plus d’un siècle de football à Saint-Nazaire, depuis le Sporting Club Nazairien fondé en 1908 jusqu’aux différentes entités qui lui ont succédé. Le club poursuit depuis cette tradition dans les compétitions régionales et nationales, avec une volonté de s’appuyer sur la formation et sur l’ancrage local pour continuer à faire vivre le football nazairien.