L’histoire du Libourne Football Association trouve ses origines en 1935, avec la fondation du Football Club de Libourne. Le club s’impose progressivement comme l’une des principales formations de Gironde et connaît son premier grand essor après la Seconde Guerre mondiale. En 1948, Libourne accède au Championnat de France Amateur (CFA), alors l’une des principales compétitions nationales du football amateur. Cette première expérience ne dure qu’une saison, mais le club retrouve brièvement le niveau national en 1952. En 1966, une nouvelle étape institutionnelle intervient lorsque la section football intègre l’association omnisports de la ville et prend le nom d’Association Sportive de Libourne.
L’AS Libourne poursuit ensuite sa progression et atteint pour la première fois la Division 3 en 1971. Après plusieurs saisons à ce niveau, le club franchit un nouveau cap en 1980 en obtenant son accession en Division 2. Cette promotion constitue l’un des premiers grands sommets de l’histoire du football libournais. L’aventure au deuxième niveau dure quatre saisons, avant une relégation en Division 3 en 1984. Dans les années suivantes, le football local est marqué par la concurrence avec l’AS Saint-Seurin, club voisin qui connaît à son tour une progression spectaculaire et atteint la Division 2 en 1989. Les deux clubs vont finalement choisir de réunir leurs forces quelques années plus tard.
La réforme des championnats nationaux du début des années 1990 entraîne une nouvelle organisation de la pyramide française. En 1994, l’AS Libourne évolue ainsi dans le nouveau National 2, qui correspond alors au quatrième niveau national. La proximité géographique et la rivalité sportive avec Saint-Seurin débouchent finalement sur une fusion en 1998. L’AS Libourne et l’AS Saint-Seurin donnent naissance au Football Club Libourne Saint-Seurin, nouvelle entité destinée à porter les ambitions du football local. Cette association va connaître ses plus belles heures au début des années 2000, avec une progression rapide dans la hiérarchie nationale.
En 2003, le FC Libourne Saint-Seurin accède au National, avant de franchir un nouveau cap trois ans plus tard. En 2006, le club termine aux premières places du championnat et obtient son accession en Ligue 2, retrouvant ainsi le deuxième niveau du football français plus de vingt ans après la précédente expérience de l'AS Libourne. Le retour au professionnalisme est cependant de courte durée : Libourne-Saint-Seurin est relégué en National en 2008, puis connaît de graves difficultés financières. En 2009, le club est rétrogradé administrativement en CFA, tandis que l'association entre Libourne et Saint-Seurin prend fin. Le club libournais reprend alors le nom de Football Club de Libourne. Une nouvelle rétrogradation administrative en CFA 2 en 2010, puis une descente sportive au niveau régional en 2011, entraînent une profonde reconstruction.
Après plusieurs années dans les compétitions régionales, Libourne parvient progressivement à retrouver les championnats nationaux. Le club retrouve le National 3 en 2017, avant de redescendre en Régional 1 en 2018. Une nouvelle remontée en National 3 intervient en 2020, puis le club réalise une progression supplémentaire en accédant au National 2 en 2023. Cette renaissance sportive est toutefois brutalement interrompue par de nouvelles difficultés financières. En 2024, le Football Club de Libourne est placé en liquidation judiciaire. Une nouvelle association, baptisée Libourne Football Association 2024, est alors créée afin de poursuivre l’activité du football libournais. De ses origines en 1935 à ses passages en Division 2 et en Ligue 2, en passant par la fusion avec Saint-Seurin et ses nombreuses reconstructions, l'histoire du club illustre la place importante occupée par Libourne dans le football girondin et aquitain.
NATIONAL
* 1 x Vainqueur groupe de CFA : 2003
* 2 x Vainqueur groupe de CFA2 et National 3 : 1999, 2023
RÉGIONAL
* 2 x Champion Ligue Sud-Ouest : 1952, 1969
* 1 x Champion Ligue Aquitaine : 2003
* 1 x Champion Ligue Nouvelle Aquitaine, gr. B : 2020
* 3 x Vainqueur Coupe du Sud-Ouest : 1941, 1946, 1978
* 3 x Vainqueur Coupe d'Aquitaine : 1986, 1987, 2004
