Fondée en 1919, l'Indépendante de Pont-Saint-Esprit est l'un des clubs historiques du football gardois. Implantée dans la commune de Pont-Saint-Esprit, l'équipe évolue pendant plusieurs décennies dans les championnats régionaux avant de s'installer durablement au plus haut niveau du football du Languedoc-Roussillon. L'Indépendante remporte le championnat de Division d'Honneur du Languedoc-Roussillon en 1989, décrochant ainsi son accession à la Division 4, alors quatrième échelon national. Cette montée marque le début de la période la plus faste de l'histoire du club. L'équipe spiripontaine s'installe immédiatement dans les championnats nationaux et dispute trois saisons consécutives en Division 4.
L'apogée sportive de l'Indépendante intervient en 1992. Le club termine en tête de son groupe de Division 4 et décroche ainsi son premier titre national, tout en obtenant une accession historique en Division 3. Pour sa première saison au troisième niveau français, en 1992-1993, Pont-Saint-Esprit réalise un parcours remarquable en terminant à la troisième place de son groupe, derrière l'Olympique de Marseille et le Gazélec Ajaccio. La réforme des compétitions nationales entraîne ensuite la disparition de la Division 3 et la création du National 2 : l'Indépendante évolue à ce niveau lors des saisons 1993-1994 et 1994-1995. Après deux saisons au quatrième niveau national, le club est relégué en National 3 en 1995, puis retrouve finalement la Division d'Honneur du Languedoc-Roussillon en 1997. Cette période, qui aura vu l'Indépendante passer en quelques années du championnat régional à la troisième division française, constitue sans conteste le sommet de son histoire.
À la fin des années 1990, les difficultés sportives poussent l'Indépendante à envisager une nouvelle organisation avec l'autre grand club du secteur, l'Union Club Bagnols Jeunesse. Les deux formations décident finalement de réunir leurs forces en 2000 afin de créer une nouvelle entité capable de relancer le football local. Le Football Club Bagnols-Pont est officiellement fondé le 21 juillet 2000, mettant fin à l'histoire de l'Indépendante de Pont-Saint-Esprit après plus de huit décennies d'existence. Le nouveau club conserve toutefois l'héritage de l'Indépendante et utilise notamment le stade du Clos Bon Aure à Pont-Saint-Esprit. Cette fusion permet au football du secteur de poursuivre son développement et donnera par la suite naissance à un club capable de retrouver à plusieurs reprises les championnats nationaux.
