Fondé en 1944 à la suite de la fusion du Sporting Club du Temple et de la Jeunesse Sportive Toulonnaise, le Sporting Club de Toulon s’impose rapidement comme le principal club de football de la ville. Après la Seconde Guerre mondiale, le club adopte le statut professionnel et participe au championnat de Division 2 dès la saison 1945-1946. Après une première relégation en 1947 et une remontée immédiate en 1948, le Sporting s’installe durablement au deuxième niveau du football français. Cette période de progression aboutit à une première accession en Division 1 en 1959, après une troisième place en D2. L’expérience dans l’élite ne dure toutefois qu’une saison, mais Toulon retrouve la première division en 1964, avant de redescendre à nouveau en 1965. Le club se distingue également en Coupe de France, avec une première demi-finale atteinte en 1963, puis une nouvelle présence dans le dernier carré en 1984.
Après plusieurs saisons passées en Division 2, le Sporting connaît son véritable âge d’or au début des années 1980. Relégué au troisième niveau en 1981, le club reconstruit une équipe ambitieuse et retrouve la Division 2, avant d'obtenir sa promotion en Division 1 en 1983. Toulon va alors s'installer durablement parmi l'élite et y rester pendant dix saisons consécutives, jusqu'en 1993. Cette période voit passer plusieurs joueurs emblématiques du football français, parmi lesquels Delio Onnis, Christian Dalger, Bernard Casoni, David Ginola ou Rolland Courbis. Le Sporting réalise notamment une remarquable cinquième place en Division 1 en 1985-1986, puis en 1987-1988, et atteint de nouveau les demi-finales de la Coupe de France en 1984. En 1993, après dix saisons consécutives dans l'élite, Toulon est sportivement relégué en Division 2 avant de subir une rétrogradation administrative en National pour des raisons financières et d'abandonner son statut professionnel. Le club est alors rebaptisé Sporting Club de Toulon 83.
Les années 1990 marquent ensuite une période particulièrement mouvementée. Après sa rétrogradation administrative, Toulon retrouve la Division 2 en 1996, en remportant le championnat de National face à Saint-Brieuc et en récupérant par la même occasion son statut professionnel. Mais cette embellie est de courte durée : dernier de Division 2 au terme de la saison 1997-1998, le club est confronté à de graves difficultés financières et connaît une liquidation judiciaire en 1998, entraînant son retour au niveau régional. Le Sporting doit alors repartir de la Division d'Honneur et entame une nouvelle reconstruction. Le club remonte progressivement les échelons et retrouve le niveau national en 2002, avec une accession au CFA 2, avant de poursuivre sa progression jusqu'au CFA puis au National en 2005. Toulon connaît toutefois de nouveaux problèmes financiers à la fin des années 2000 : en 2011, la DNCG prononce une rétrogradation administrative et le club doit repartir en Division d'Honneur.
Depuis les années 2010, le SC Toulon poursuit sa reconstruction avec l'ambition de retrouver progressivement les divisions professionnelles. Après sa rétrogradation en Division d'Honneur en 2011, le club remonte jusqu'au CFA 2 en 2014, puis réalise une nouvelle accession au CFA en 2016 après avoir terminé premier de son groupe. Cette même année, le Sporting Toulon Var absorbe le SC Le Las, club voisin qui évoluait alors en CFA, permettant de réunifier les forces du football toulonnais sous les couleurs historiques du Sporting.
NATIONAL
* 1 x Vice-champion de France Division 2 : 1983
* 1 x Finaliste Coupe Charles Drago : 1960
* 1 x Finaliste Coupe de la Ligue : 1965
* 1 x Champion de France National 1 : 1996
* 1 x Vainqueur de groupe de Division 3 : 1981
* 2 x Vainqueur de groupe CFA et National 2 : 2005, 2019
* 2 x Vainqueur de groupe de CFA2 : 2003, 2016
RÉGIONAL
* 3 x Champion Ligue Méditerranée : 1998, 2002, 2014