Le Bourges 18 est fondé en 2008 à la suite de la fusion entre le Bourges Football et le Bourges-Asnières 18. Cette création s'inscrit dans une histoire plus ancienne du football berruyer, puisque le Bourges Football est lui-même l'héritier du FC Bourges, fondé en 1966 et ancien pensionnaire de la Division 2 française. Le FC Bourges avait notamment évolué à plusieurs reprises au deuxième niveau national et connu le statut professionnel au début des années 1990, avant de disparaître à la suite de difficultés financières. Après une nouvelle reconstruction sous les noms de Bourges Football Olympique Club puis Bourges Football, la fusion de 2008 donne naissance au Bourges 18.
Dès sa première saison, le Bourges 18 connaît une réussite sportive importante. Le club remporte le championnat de Division d'Honneur Centre en 2009 et obtient ainsi son accession en CFA 2, alors cinquième niveau du football français. Cette montée permet au nouveau club berruyer de retrouver rapidement les championnats nationaux. Le Bourges 18 s'installe ensuite plusieurs saisons en CFA 2, malgré des exercices parfois difficiles, et remporte notamment la Coupe du Centre en 2013 et 2014, deux des principaux succès de son histoire.
Après plusieurs années en championnat national, le Bourges 18 retrouve le National 3 à la suite de la réforme des championnats en 2017. La saison 2019-2020 marque un nouveau tournant : alors que le club occupe la deuxième place de son groupe de National 3 au moment de l'interruption des compétitions liée à la pandémie de Covid-19, il bénéficie finalement de la situation du Tours FC, interdit de promotion pour des raisons financières. Le Bourges 18 accède ainsi au National 2 pour la saison 2020-2021, retrouvant le quatrième échelon national. Cette accession est d'autant plus symbolique que le club partage alors ce niveau avec l'autre formation importante de la ville, le Bourges Foot.
Cette situation conduit à un rapprochement entre les deux clubs berruyers. Après plusieurs mois de discussions, le Bourges 18 et le Bourges Foot fusionnent en 2021 afin de réunir les forces du football de la ville. La nouvelle entité prend le nom de Bourges Foot 18 et conserve une place en National 2. Le nouveau club devient rapidement l'une des principales structures sportives de la région Centre-Val de Loire, avec plusieurs dizaines d'équipes et plusieurs centaines de licenciés. Cette fusion marque ainsi la disparition du Bourges 18 en tant qu'entité indépendante, tout en permettant à son histoire et à son héritage sportif de se poursuivre au sein du club berruyer issu de cette union.
